据大地湾文物保护研究所程晓钟所长介绍，根据设计方案，博物馆将建在大地湾遗址保护范围外围清水河南岸古河道与缓山坡交叉处，占地面积26680平方米。博物馆建筑呈折线形延伸到古河道，处于半地下状态，内部是一个开放、连续且富于变化的展厅。整个建筑与周围环境地貌、自然风景、古遗址所反映的原始文化内涵协调统一，将成为生态、绿色、可持续发展的遗址博物馆建筑。按设计方案，博物馆建筑总面积3155平方米，分陈列区与办公管理、库房区两部分，设计概算1700万元。